Apport de la biologie moléculaire pour une meilleure prise en charge des tumeurs des tissus mous

Apport de la biologie moléculaire pour une meilleure prise en charge des tumeurs des tissus mous

Annales de pathologie (2012) 32S, S103—S107 Disponible en ligne sur www.sciencedirect.com SYMPOSIUM Apport de la biologie moléculaire pour une mei...

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Annales de pathologie (2012) 32S, S103—S107

Disponible en ligne sur

www.sciencedirect.com

SYMPOSIUM

Apport de la biologie moléculaire pour une meilleure prise en charge des tumeurs des tissus mous夽 Contribution of molecular biology for better management of soft tissue tumors Agnès Neuville Département de pathologie, institut Bergonié, 229, cours de l’Argonne, 33076 Bordeaux cedex, France Accepté pour publication le 12 juillet 2012 Disponible sur Internet le 12 octobre 2012

Le diagnostic des tumeurs des tissus mous est difficile. Il bénéficie de plus en plus de la mise en évidence d’anomalies génétiques spécifiques [1], grâce à des techniques de génétique moléculaire développées pour une utilisation en routine, le plus souvent applicables sur du matériel fixé au formaldéhyde et inclus en paraffine.

Anomalies moléculaires Les tumeurs des tissus mous peuvent être séparées selon le type d’anomalies moléculaires : les tumeurs avec des anomalies moléculaires simples le plus souvent spécifiques (translocations réciproques, mutations activatrices, mutations inactivatrices et amplifications simples) et les tumeurs avec des anomalies moléculaires complexes.



Symposium présenté le jeudi 22 novembre 2012 de 14 h 30 à 16 h 30, salle 101. Adresse e-mail : [email protected]

0242-6498/$ — see front matter © 2012 Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés. http://dx.doi.org/10.1016/j.annpat.2012.07.014

S104

A. Neuville

Tableau récapitulatif des anomalies actuellement détectables. Chromosomes impliqués

Gènes impliqués

Prévalence

Méthodes de détection

Implication pratique

t(11;22)(q24;q12) t(21;22)(q22;q12) t(7;22)(p22;q12) t(17;22)(q12;q12) t(2;22)(q33;q12) t(1;22)(p36;q12) t(16;21)(p11;q22) t(4;22)(q31;q12)

EWSR1-FLI1 EWSR1-ERG EWSR1-ETV1 EWSR1-ETV4 EWSR1-FEV EWSR1-ZSG FUS-ERG EWSR1SMARCA5

85—95 % 5—10 % <1% Rare Rare Rare Rare Rare

FISH EWS RT-PCR

Diagnostic Traitement

Sarcome à cellules rondes [2]

t(4;10)(q35;10q26)

CIC-DUX4

Rare

RT-PCR

Diagnostic

Sarcome à cellules rondes [3]

T(X;X)(p11;p11)

BCOR-CCNB3

Rare

RT-PCR IHC CCNB3

Diagnostic

Synovialosarcome

t(X;18)(p11;q11) t(X;18)(p11;q11) t(X;18)(p11;q13) t(X;20)(p11;q13)

SS18-SSX1 SS18-SXX2 SS18-SSX4 SS18L1-SSX1

65 % 35 % Rare Rare

FISH SS18 RT-PCR IHC TLE1

Diagnostic Traitement

Liposarcome myxoïde

t(12;16)(q13;p11)

FUS-DDIT3

95 %

FISH FUS/EWS

Diagnostic

t(12;22)(q13;q12)

EWSR1-DDIT3

Rare

RT-PCR

Traitement

t(2;13)(q35;q14)

PAX3-FOXO1A

60—80 %

FISH FOXO1A

Diagnostic

t(1;13)(p36;q14) t(2;X)(p35;q13) t(2;2)(p35;q23)

PAX7-FOXO1A PAX3-MLLT7 PAX3-NCOAI

10—20 % Rare Rare

RT-PCR

Pronostic Traitement

t(12;22)(q13;q12)

ATF1-EWSR1

> 90 %

FISH EWS

Diagnostic

t(2;22)(q33;q12)

EWSR1-CREB1

Rare

RT-PCR

t(9;22)(q22;q12)

EWSR1-NR4A3

75 %

FISH EWS

t(9;17)(q22;q11) t(9;15)(q22;q21) t(9;22)(q22;q15)

TAF2N- NR4A3 TCF12- NR4A3 TFG-NR4A3

25 % Rare Rare

RT-PCR

t(11;22)(p13;q12)

WT1-EWSR1

> 90 %

IHC WT1

t(21;22)(q22;q12)

ERG-EWSR1

Rare

FISH RT-PCR

t(7;16)(q33;p11)

FUS-CREB3L2

90 %

FISH FUS

t(11;16)(p11;p11)

FUS-CREB3L1

10 %

RT-PCR

Dermatofibrosarcome de Darier et Ferrand

t(17;22)(q22;q13)

COL1A1PDGFB

> 90 %

FISH

Diagnostic Traitement

Fibroblastome à cellules géantes

t(17;22)(q22;q13)

COL1A1PDGFB

> 90 %

FISH

Diagnostic

Sarcome alvéolaire des parties molles

t(X;17)(p11;q25)

ASPL-TFE3

> 90 %

IHC TFE3

Diagnostic

Translocations 25—30 % Ewing/PNET

Rhabdomyosarcome alvéolaire

Sarcome à cellules claires Chondrosarcome myxoïde extrasquelettique

Tumeur desmoplastique à petites cellules rondes

Sarcome fibromyxoïde de bas grade

RT-PCR, FISH

Diagnostic

Diagnostic

Diagnostic

Apport de la biologie moléculaire

S105

Tableau ( Suite )

Fibrosarcome infantile

Chromosomes impliqués

Gènes impliqués

Prévalence

Méthodes de détection

Implication pratique

t(12;15)(p13;q25)

ETV6-NTRK3

80—90 %

FISH

Diagnostic

RT-PCR t(2;19)(q23;q13)

TPM4-ALK

t(1;2)(q25;q23) t(2;17)(p23;q23) t(2;11)(q23;q23) t(2;2)(p23;q13)

TPM3-ALK CLTC-ALK CARS-ALK RANBP2-ALK

t(7;17)(p15;q21)

JAZF1-SUZ12

60 %

t(6;7)(p21;p15) t(6;10)(p21;p11)

JAZF1-PHF1 EPC1-PHF1

1% Rare

SSE de haut grade

t(10;17)(q22;p13)

YWHAE-FAM22

Histiocytome fibreux angiomatoïde

t(2;22)(q34;q12)

Tumeur myofibroblastique inflammatoire

> 50 %

IHC ALK

Diagnostic

FISH ALK RT-PCR

FISH

Diagnostic

*

FISH

Diagnostic

EWSR1-CREB1

90 %

FISH EWS/FUS

Diagnostic

t(12;22)(q13;q12) t(12;16)(q13;q11)

EWSR1-ATF1 ATF1-FUS

10 % Rare

Lipoblastome

t(8;8)(q12;q24) t(8;7)(q12;q22)

PLAG1-HAS2 PLAG1- COL1A

> 80 %

FISH PLAG1

Diagnostic

Hémangioendothéliome épithélioïde

t(1;3)(p36;q25)

WWTR1CAMTA1

60 %

FISH

Diagnostic

Tumeur ténosynoviale à cellules géantes

t(1;2)(q13;q35)

CSF1-COL6A3

*

IHC CSF1

Diagnostic

Myoépithéliome

t(22;1)

45 %

FISH EWS

Diagnostic

t(22;6) t(22;19) t(16)

EWSR1POU5F1 EWSR1-PBX1 EWSR1-ZNF444 FUS

4q12

KIT

80 %

IHC KIT/DOG1

Diagnostic

4q12 1p36

PDGFRA SDH

10 % Rare

Séquenc ¸age IHC SDHB

Pronostic Traitement

APC CTNNB1 GNAS1

<5% > 85 % 50 %

Séquenc ¸age

Diagnostic

Myxome

5q21 3p21 20q13

Séquenc ¸age

Diagnostic

Mutations inactivatrices <1% Tumeur rhabdoïde

22q11

SMARCB1

> 90 %

IHC INI1 FISH

Diagnostic

12q13-15

MDM2

95—100 %

IHC, FISH

Diagnostic

12q15

CDK4

90—95 %

MDM2/CDK4

Traitement

Sarcome du stroma endométrial (SSE) de bas grade

Mutations activatrices 10—15 % Tumeur stromale intestinale

Tumeur desmoïde

Amplification 10—15 % LPS bien différencié dédifférencié

FISH FUS

S106

A. Neuville

Tableau ( Suite ) Chromosomes impliqués

Gènes impliqués

Prévalence

Méthodes de détection

Implication pratique

Q-PCR CGH-array Angiosarcome sur tissus irradiés

8q24

MYC

> 50 %

FISH

Diagnostic

IHC MYC Génétique complexe 40—50 % Sarcome inclassé Léiomyosarcome Myxofibrosarcome LPS pléomorphe

IHC : immuno-histochimie; FISH : fluorescence in situ hybridization ; RT-PCR : reverse transcription polymerase chain reaction; Q-PCR : quantitative polymerase chain reaction ; LPS ; liposarcome, CGH : comparative genomic hybridization ; * : données insuffisantes.

Impacts diagnostiques Les analyses de biologie moléculaire complètent les analyses morphologiques et immuno-histochimiques et sont parfois indispensables dans certaines situations. Aide au diagnostic bénin/malin : • lipome versus liposarcome bien différencié [4] ; • myxome versus myxofibrosarcome ; • fasciite versus tumeur desmoïde [5] ; • lésion vasculaire atypique versus angiosarcome [6] ; • tumeur musculaire lisse utérine ; • lésion réactionnelle versus sarcome à génétique complexe. Aide au diagnostic des tumeurs des enfants/adultes jeunes : • identification du type histologique au sein des sarcomes à cellules rondes ; • identification de nouvelles formes de sarcomes à cellules rondes [2,3]. Aide au diagnostic de tumeurs difficiles ou de tumeurs de forme ou de localisation inhabituelles : • hémangioendothéliome épithélioïde versus angiosarcome [7] ; • liposarcome dédifférencié hors du rétropéritoine ; • synovialosarcome peu différencié ou hors des membres [8].

Impacts pronostiques et thérapeutiques Les schémas thérapeutiques sont de plus en plus fonction du type histo-moléculaire :

CGH-array

Diagnostic

• traitement et survie fonction de la présence/absence et du type de transcrit dans les rhabdomyosarcomes embryonnaires/alvéolaires [9] ; • chimiothérapie néoadjuvante pour les sarcomes d’Ewing, synovialosarcomes, liposarcomes myxoïde/à cellules rondes, tumeur desmoplastique à petites cellules rondes ; • discussion d’une abstention de chimiothérapie pour les liposarcomes bien différenciés/dédifférenciés ; • protocole de radiothérapie néoadjuvante dans les liposarcomes bien différenciés/dédifférenciés du rétropéritoine ; • utilisation de thérapeutiques ciblées si présence de l’anomalie génétique (anti-MDM2, anti-ALK, inhibiteurs de tyrosine kinase = TKI. . .) ; • type de mutation influenc ¸ant la survie globale dans les GIST ; • réponse aux TKI fonction du type de mutation dans les GIST.

Conclusion La détection d’anomalies génétiques est parfois indispensable pour arriver à un diagnostic précis. Les anomalies génétiques simples sont de plus en plus intégrées à la classification morphologique. Il est donc recommandé de les rechercher systématiquement. Cette nouvelle classification morpho-moléculaire déterminera de plus en plus des schémas thérapeutiques personnalisés [10].

Déclaration d’intérêts L’auteur n’a pas transmis de déclaration de conflits d’intérêts.

Références [1] Coindre JM. Biologie moléculaire des sarcomes. Bull Cancer 2010;97:1337—45.

Apport de la biologie moléculaire [2] Italiano A, Sung YS, Zhang L, Singer S, Maki RG, Coindre JM, et al. High prevalence of CIC fusion with double-homeobox (DUX4) transcription in EWSR1-Negative undifferentiated small blue round cell sarcomas. Genes Chromosomes Cancer 2012;51:207—18. [3] Pierron G, Tirode F, Lucchesi C, Reynaud S, Ballet S, CohenGogo S, et al. A new subtype of bone sarcoma defined by BCORCCNB3 gene fusion. Nat Genet 2012;44:461—6. [4] Zhang H, Erickson-Johnson M, Wan X, Oliveira JL, Nascimento AG, Sim FH, et al. Molecular testing for lipomatous tumors: critical analysis and test recommendations based on the analysis of 405 extremity-based tumors. Am J Surg Pathol 2010;34:1304—11. [5] Le Guellec S, Soubeyran I, Rochaix P, Filleron T, Neuville A, Hostein I, Coindre JM. CTNNB1 mutation analysis is a useful tool for the diagnosis of desmoid tumors: a study of 260 desmoid tumors and 191 potential morphologic mimics. Mod Pathol 2012, 10.1038/modpathol.2012.115.

S107 [6] Manner J, Radlwimmer B, Hohenberger P, Mössinger K, Küffer S, Sauer C, et al. MYC high level gene amplification is a distinctive feature of angiosarcomas after irradiation or chronic lymphedema. Am J Pathol 2010;176:34—9. [7] Errani C, Zhang L, Sung YS, Hajdu M, Singer S, Maki RG, et al. A novel WWTR1-CAMTA1 gene fusion is a consistent abnormality in epithelioid hemangioendothelioma of different anatomic sites. Genes Chromosomes Cancer 2011;50:644—53. [8] Coindre JM, Pelmus M, Hostein I, et al. Should molecular testing be required for diagnosing synovial sarcoma? A prospective study of 204 cases. Cancer 2003;98:2700—7. [9] Williamson D, Missiaglia E, de Reyniès A, Pierron G, Thuille B, Palenzuela G, et al. Fusion gene-negative alveolar rhabdomyosarcoma is clinically and molecularly indistinguishable from embryonal rhabdomyosarcoma. Clin Oncol 2010;28:2151—8. [10] Jain S, Xu R, Prieto VG, Lee P. Molecular classification of soft tissue sarcomas and its clinical applications. Int J Clin Exp Pathol 2010;3:416—28.