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Sélection de seuil pour biomarqueurs prédictifs utilisant la régression de Cox. Une application pour le cancer du poumon non à petites cellules
S70
EPI-CLIN 2015 / Revue d’Épidémiologie et de Santé Publique 63S (2015) S61–S89
des infirmiers interrogés. L’autopalpation était considérée comme moyen de dépistage du cancer du sein pour 94,7 % des infirmiers. Pour 74,4 % des infirmiers le dépistage du cancer du sein doit être fait à partir de 45 ans et plus, la majorité (80,3 %) des infirmiers étaient favorable à la participation aux activités du programme de détection précoce du sein. Conclusion Cette étude a montré un niveau de connaissance des infirmiers très moyen. Des efforts sont nécessaires pour améliorer les connaissances de cette catégorie en matière de dépistage du cancer du sein, et de programmer des formations continues au profit des infirmiers dans les prochaines programmes. Mots clés Connaissance des infirmiers ; Participation ; Cancer du sein ; Dépistage ; Maroc
Conclusion La forme et l’évolution de la tuberculose sont différentes entre les patients diabétiques et non diabétiques. Il est donc très intéressent de prendre en considération la présence de cette comorbidité lors du diagnostic, du traitement et de la surveillance de la tuberculose, mais également le dépistage systématique du diabète chez les tuberculeux. Mots clés Tuberculose ; Comorbidité ; Diabète ; Kenitra ; Maroc Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.073
Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.072
P8 - Méthodes et modèles statistiques pour la recherche clinique et épidémiologique
P7 - Méthodes pour la recherche en soins primaires
P8.1
P7.1
La comorbidité diabète–tuberculose dans la province de Kenitra, Maroc Frindy a,∗ ,
Jabbari b ,
Akrim c ,
Razine d
M. M. M. R. Direction régionale de la santé de Rabat, Rabat, Maroc b Centre de santé urbain, Kenitra, Maroc c École nationale de santé publique, Rabat, Maroc d Département de santé publique, Laboratoire d’épidémiologie et de recherche clinique. faculté de médecine et de pharmacie, Université Mohammed V de Rabat, Rabat, Maroc ∗ Auteur correspondant. Adresse e-mail : [email protected] (M. Frindy) a
Introduction Le diabète est associé avec un risque plus important de développer une maladie infectieuse notamment en Afrique. Ainsi l’association du diabète à la tuberculose est bien établie. Ces observations sont d’une grande importance dans les pays tel que le Maroc qui vit une transition épidémiologique dite de la double charge c’est-à-dire le groupe tout entier des maladies non transmissibles dont les facteurs de risques sont communs vient s’ajouter aux maladies transmissibles qui continuent de sévir. Méthodes L’étude porte sur le premier semestre de l’année 2013. Il s’agit d’une étude épidémiologique descriptive rétrospective basée sur l’exploitation des dossiers de tuberculeux du centre de référence my lhassan province de Kenitra Maroc. Elle portait sur 253 patients tuberculeux référés durant la période considérée. Les variables étudiées portaient sur l’âge, le sexe, la forme de la tuberculose (pulmonaire et extrapulmonaire), le type de diabète, la survenue ou non de complications et l’évolution. La saisie et l’analyse des données ont été faites par le logiciel SPSS.13.0. Résultats Au total, 253 patients tuberculeux ont été rec¸us au cours de cette période. L’âge moyen des patients était de 38 ± 18,5 ans. La proportion de femmes était de 42,3 % (107) et celle des hommes était de 57,7 % (146). Parmi les 146 cas (57,7 %) de tuberculose pulmonaire, 4 % (10) étaient des cas TPM−, 7,1 % (18) étaient des cas TPM, 46,6 % (118) étaient des cas TPM+. Par ailleurs, nous avons eu 107 cas (42,3 %) de tuberculose extrapulmonaire repartis en ganglionnaire 12,6 % (32), mal de Pott 3,6 % (9), miliaire tuberculose 2 % (5), péritonéale 9,1 % (23), et pleurales 15,4 %(39). Parmi l’ensemble des malades 20,6 % (52) avaient une association diabète–tuberculose dont 51,9 % (27) diabétiques insulino-dépendants et 48,1 % (25) diabétiques non insulino-dépendants et 6 % (15) ont fait une décompensation de leur diabète. Les patients tuberculeux diabétiques étaient plus âgés (53,3 ± 14,7 ans versus 34,1 ± 17,2 ans) (p < 0,001). La tuberculose pulmonaire était plus fréquente chez les diabétiques (92,3 % versus 48,8 %, p < 0,001) et la tuberculose extrapulmonaire était plus fréquente chez les non diabétiques (51,2 % versus 7,7 %, p < 0,001). La survenue de complications a été plus fréquente chez les patients diabétiques (13,5 % versus 4 %, p < 0,018).
Sélection de seuil pour biomarqueurs prédictifs utilisant la régression de Cox. Une application pour le cancer du poumon non à petites cellules P. Lorenzo-Luaces a,∗ , L. Sanchez a , J. Ballesteros b , B. García a , P.C. Rodríguez a , C. Viada a , M. Alvarez a , X. Popa a , T. Crombet a , A. Lage a a Center of Molecular Immunology, La Havane, Cuba b University of the Basque Country, UPV/EHU & CIBERSAM, Leioa, Espagne ∗ Auteur correspondant. Adresse e-mail : [email protected] (P. Lorenzo-Luaces) Objectifs Proposer une méthodologie pour déterminer le seuil optimal d’un biomarqueur pour prédire l’effet d’un traitement sur une variable de type « timeto-event ». Méthodes Nous proposons un algorithme pour dichotomiser un biomarqueur basé sur le modèle de régression de Cox. Il est appliqué à la concentration basale du facteur de croissance épidermique (EGF) comme biomarqueur prédictif associé à l’efficacité du vaccin CIMAvaxEGF sur la survie du cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC). Nous avons ensuite identifié les seuils possibles à partir desquels un effet significatif du traitement est observé. Ceci permettant de sélectionner le seuil le plus bas où la différence entre traitements devient significative et celui dont l’écart entre traitement est le plus important. Résultats Pour NSCLC nous avons observé d’importants seuils de concentration du EGF sur la gamme de 870 à 2030 pg/mL. Les ratios de risque sont inférieurs à 0,55 et les médianes de survie diffèrent de plus de 1,44 mois, favorisant le traitement d’immunothérapie. Conclusion La méthodologie présentée ici pourrait être utilisée pour sélectionner des seuils de biomarqueurs prédictifs dans le contexte des variables « time-to-event ». Il a été appliqué pour sélectionner des seuils pour un biomarqueur spécifique. Ceci en tenant compte non seulement de la signification statistique, mais aussi de la pertinence clinique des résultats. Mots clés Biomarqueur ; Seuil ; Modèle de Cox ; NSCLC ; Cancer ; Vaccin Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.074 P8.2
Utilisation de la PCR multiplex comme outil diagnostique de la pneumopathie aiguë communautaire L. Grammatico-Guillon a,∗ , A. Guillon b , J. Sonke c , D. Garot b , A. Chaillon d , C. Gaudy-Graffin d , A. Goudeau d a Service d’information médicale d’épidémiologie et d’économie de la santé, CHRU de Tours, Laboratoire de santé publique, Université F.-Rabelais, Tours, France
EPI-CLIN 2015 / Revue d’Épidémiologie et de Santé Publique 63S (2015) S61–S89
des infirmiers interrogés. L’autopalpation était considérée comme moyen de dépistage du cancer du sein pour 94,7 % des infirmiers. Pour 74,4 % des infirmiers le dépistage du cancer du sein doit être fait à partir de 45 ans et plus, la majorité (80,3 %) des infirmiers étaient favorable à la participation aux activités du programme de détection précoce du sein. Conclusion Cette étude a montré un niveau de connaissance des infirmiers très moyen. Des efforts sont nécessaires pour améliorer les connaissances de cette catégorie en matière de dépistage du cancer du sein, et de programmer des formations continues au profit des infirmiers dans les prochaines programmes. Mots clés Connaissance des infirmiers ; Participation ; Cancer du sein ; Dépistage ; Maroc
Conclusion La forme et l’évolution de la tuberculose sont différentes entre les patients diabétiques et non diabétiques. Il est donc très intéressent de prendre en considération la présence de cette comorbidité lors du diagnostic, du traitement et de la surveillance de la tuberculose, mais également le dépistage systématique du diabète chez les tuberculeux. Mots clés Tuberculose ; Comorbidité ; Diabète ; Kenitra ; Maroc Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.073
Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.072
P8 - Méthodes et modèles statistiques pour la recherche clinique et épidémiologique
P7 - Méthodes pour la recherche en soins primaires
P8.1
P7.1
La comorbidité diabète–tuberculose dans la province de Kenitra, Maroc Frindy a,∗ ,
Jabbari b ,
Akrim c ,
Razine d
M. M. M. R. Direction régionale de la santé de Rabat, Rabat, Maroc b Centre de santé urbain, Kenitra, Maroc c École nationale de santé publique, Rabat, Maroc d Département de santé publique, Laboratoire d’épidémiologie et de recherche clinique. faculté de médecine et de pharmacie, Université Mohammed V de Rabat, Rabat, Maroc ∗ Auteur correspondant. Adresse e-mail : [email protected] (M. Frindy) a
Introduction Le diabète est associé avec un risque plus important de développer une maladie infectieuse notamment en Afrique. Ainsi l’association du diabète à la tuberculose est bien établie. Ces observations sont d’une grande importance dans les pays tel que le Maroc qui vit une transition épidémiologique dite de la double charge c’est-à-dire le groupe tout entier des maladies non transmissibles dont les facteurs de risques sont communs vient s’ajouter aux maladies transmissibles qui continuent de sévir. Méthodes L’étude porte sur le premier semestre de l’année 2013. Il s’agit d’une étude épidémiologique descriptive rétrospective basée sur l’exploitation des dossiers de tuberculeux du centre de référence my lhassan province de Kenitra Maroc. Elle portait sur 253 patients tuberculeux référés durant la période considérée. Les variables étudiées portaient sur l’âge, le sexe, la forme de la tuberculose (pulmonaire et extrapulmonaire), le type de diabète, la survenue ou non de complications et l’évolution. La saisie et l’analyse des données ont été faites par le logiciel SPSS.13.0. Résultats Au total, 253 patients tuberculeux ont été rec¸us au cours de cette période. L’âge moyen des patients était de 38 ± 18,5 ans. La proportion de femmes était de 42,3 % (107) et celle des hommes était de 57,7 % (146). Parmi les 146 cas (57,7 %) de tuberculose pulmonaire, 4 % (10) étaient des cas TPM−, 7,1 % (18) étaient des cas TPM, 46,6 % (118) étaient des cas TPM+. Par ailleurs, nous avons eu 107 cas (42,3 %) de tuberculose extrapulmonaire repartis en ganglionnaire 12,6 % (32), mal de Pott 3,6 % (9), miliaire tuberculose 2 % (5), péritonéale 9,1 % (23), et pleurales 15,4 %(39). Parmi l’ensemble des malades 20,6 % (52) avaient une association diabète–tuberculose dont 51,9 % (27) diabétiques insulino-dépendants et 48,1 % (25) diabétiques non insulino-dépendants et 6 % (15) ont fait une décompensation de leur diabète. Les patients tuberculeux diabétiques étaient plus âgés (53,3 ± 14,7 ans versus 34,1 ± 17,2 ans) (p < 0,001). La tuberculose pulmonaire était plus fréquente chez les diabétiques (92,3 % versus 48,8 %, p < 0,001) et la tuberculose extrapulmonaire était plus fréquente chez les non diabétiques (51,2 % versus 7,7 %, p < 0,001). La survenue de complications a été plus fréquente chez les patients diabétiques (13,5 % versus 4 %, p < 0,018).
Sélection de seuil pour biomarqueurs prédictifs utilisant la régression de Cox. Une application pour le cancer du poumon non à petites cellules P. Lorenzo-Luaces a,∗ , L. Sanchez a , J. Ballesteros b , B. García a , P.C. Rodríguez a , C. Viada a , M. Alvarez a , X. Popa a , T. Crombet a , A. Lage a a Center of Molecular Immunology, La Havane, Cuba b University of the Basque Country, UPV/EHU & CIBERSAM, Leioa, Espagne ∗ Auteur correspondant. Adresse e-mail : [email protected] (P. Lorenzo-Luaces) Objectifs Proposer une méthodologie pour déterminer le seuil optimal d’un biomarqueur pour prédire l’effet d’un traitement sur une variable de type « timeto-event ». Méthodes Nous proposons un algorithme pour dichotomiser un biomarqueur basé sur le modèle de régression de Cox. Il est appliqué à la concentration basale du facteur de croissance épidermique (EGF) comme biomarqueur prédictif associé à l’efficacité du vaccin CIMAvaxEGF sur la survie du cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC). Nous avons ensuite identifié les seuils possibles à partir desquels un effet significatif du traitement est observé. Ceci permettant de sélectionner le seuil le plus bas où la différence entre traitements devient significative et celui dont l’écart entre traitement est le plus important. Résultats Pour NSCLC nous avons observé d’importants seuils de concentration du EGF sur la gamme de 870 à 2030 pg/mL. Les ratios de risque sont inférieurs à 0,55 et les médianes de survie diffèrent de plus de 1,44 mois, favorisant le traitement d’immunothérapie. Conclusion La méthodologie présentée ici pourrait être utilisée pour sélectionner des seuils de biomarqueurs prédictifs dans le contexte des variables « time-to-event ». Il a été appliqué pour sélectionner des seuils pour un biomarqueur spécifique. Ceci en tenant compte non seulement de la signification statistique, mais aussi de la pertinence clinique des résultats. Mots clés Biomarqueur ; Seuil ; Modèle de Cox ; NSCLC ; Cancer ; Vaccin Déclaration d’intérêts Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d’intérêts en relation avec cet article. http://dx.doi.org/10.1016/j.respe.2015.03.074 P8.2
Utilisation de la PCR multiplex comme outil diagnostique de la pneumopathie aiguë communautaire L. Grammatico-Guillon a,∗ , A. Guillon b , J. Sonke c , D. Garot b , A. Chaillon d , C. Gaudy-Graffin d , A. Goudeau d a Service d’information médicale d’épidémiologie et d’économie de la santé, CHRU de Tours, Laboratoire de santé publique, Université F.-Rabelais, Tours, France